Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 FBXO3-201ENST00000265651 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 SLC24A4-205ENST00000532405 9950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 EPB41L4A-211ENST00000621003 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 TRAF1-203ENST00000546084 3715 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 SCAF8-202ENST00000367186 4908 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
HOXD11P31277 GRAMD2A-201ENST00000309731 3281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 NELL1-211ENST00000532434 2400 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 LARP1B-210ENST00000512292 3105 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 WDR36-206ENST00000612402 6592 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AP1G1-202ENST00000393512 3593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 CFAP61-205ENST00000377306 2017 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 GFOD1-202ENST00000379284 8061 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 STX17-201ENST00000259400 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 CTCFL-216ENST00000608263 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 LPXN-202ENST00000528489 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 DNAH14-211ENST00000445597 10524 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 TTL-201ENST00000233336 14269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ARHGEF9-225ENST00000636276 4097 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 HIST1H2BC-202ENST00000396984 571 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AL109933.1-201ENST00000448126 292 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RN7SL757P-201ENST00000466709 301 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC139365.1-201ENST00000519417 322 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 OR5M5P-201ENST00000529703 936 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RAD52-218ENST00000545564 681 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 SRSF5-204ENST00000553548 526 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 ITIH6-201ENST00000218436 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 RABGEF1-208ENST00000510829 3553 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 MSANTD3-TMEFF1-201ENST00000502978 2069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 LRRC40-201ENST00000370952 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 LINC01498-201ENST00000502160 2984 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 KIF3B-201ENST00000375712 6103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 SLC30A9-201ENST00000264451 6218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 SERPINB6-202ENST00000380520 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 AC097662.1-201ENST00000439598 2568 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 SOX5-215ENST00000545921 2589 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 TRIM43-201ENST00000272395 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC138207.4-201ENST00000580979 1661 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 SERINC3-202ENST00000342374 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ZNF423-203ENST00000561648 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 PEX1-203ENST00000428214 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 SELP-206ENST00000458599 1945 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ACOT11-202ENST00000371316 6369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 SLA-202ENST00000395352 2102 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 SDHDP2-201ENST00000436937 465 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RPSAP18-201ENST00000453374 886 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ABT1P1-201ENST00000511060 821 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 SCARNA20.3-201ENST00000516913 131 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 IGKV3-25-201ENST00000523155 253 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC009060.2-201ENST00000569264 106 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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