Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 THBS4-204ENST00000511733 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC120024.4-201ENST00000624285 2143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PGA3-201ENST00000325558 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 HHAT-204ENST00000413764 3575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNG4-201ENST00000262138 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DOPEY2-202ENST00000399151 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO5B-201ENST00000285039 9505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CPEB1-215ENST00000617958 2776 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR50-201ENST00000218316 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CD5-201ENST00000347785 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PKD2L1-201ENST00000318222 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CSE1L-202ENST00000396192 3459 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CHST4-201ENST00000338482 2412 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PREPL-208ENST00000410081 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NRP1-201ENST00000265371 5882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 IGSF11-208ENST00000489689 3320 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TUFT1-203ENST00000368849 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MX1-201ENST00000288383 2733 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC020978.10-201ENST00000623181 2704 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ACTR3C-206ENST00000613959 5142 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LILRB1-206ENST00000396332 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRN2-202ENST00000367176 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms