Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AMPD3-208ENST00000528723 2753 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 CAPN3-206ENST00000397163 3228 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 GFRAL-201ENST00000340465 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 ZNF343-201ENST00000278772 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 LINC00558-201ENST00000569422 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 OPTN-204ENST00000378752 3488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 SNX19P2-201ENST00000452841 2971 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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