Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01558Q9Y6Z2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
LINC01558Q9Y6Z2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms