Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXBP1Q9Y5B6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms