Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMM50Q9Y512 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAMM50Q9Y512 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms