Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms