Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms