Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPN3Q9UHW5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms