Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC6Q9UBN7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC6Q9UBN7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms