Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PODXL2Q9NZ53 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PODXL2Q9NZ53 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms