Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM28Q9NW13 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms