Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms