Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3GLB2Q9NR46 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GLB2Q9NR46 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms