Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ASCL3Q9NQ33 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms