Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEMA4BQ9NPR2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA4BQ9NPR2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms