Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms