Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms