Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAGR1Q9BTK6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAGR1Q9BTK6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms