Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCGF1Q9BSM1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PCGF1Q9BSM1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms