Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNS3Q9BQ31 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms