Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GAL3ST1Q99999 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GAL3ST1Q99999 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms