Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POP1Q99575 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POP1Q99575 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP1Q99575 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP1Q99575 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP1Q99575 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP1Q99575 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms