Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARXQ96QS3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms