Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TSNARE1Q96NA8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSNARE1Q96NA8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms