Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CMTM5Q96DZ9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CMTM5Q96DZ9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms