Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC1Q96C34 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUNDC1Q96C34 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms