Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJA10Q969M2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms