Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HGDQ93099 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HGDQ93099 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HGDQ93099 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HGDQ93099 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HGDQ93099 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HGDQ93099 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HGDQ93099 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HGDQ93099 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HGDQ93099 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HGDQ93099 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HGDQ93099 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HGDQ93099 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HGDQ93099 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HGDQ93099 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms