Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBLCP1Q8WVY7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms