Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDI1Q8WTU0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDI1Q8WTU0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDI1Q8WTU0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDI1Q8WTU0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDI1Q8WTU0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDI1Q8WTU0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDI1Q8WTU0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms