Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FSIP1Q8NA03 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FSIP1Q8NA03 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms