Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFNL3Q8IZI9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFNL3Q8IZI9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms