Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CATSPER4Q7RTX7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CATSPER4Q7RTX7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms