Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TCF23Q7RTU1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms