Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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