Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM47EQ6ZV65 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM47EQ6ZV65 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms