Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CFAP47Q6ZTR5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CFAP47Q6ZTR5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms