Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMIGD1Q6UXZ0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms