Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC137Q6PK04 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms