Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
ALS2CLQ60I27 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms