Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB6CQ53S08 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB6CQ53S08 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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