Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00303Q3SY05 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00303Q3SY05 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms