Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM71Q2Q1W2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
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