Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB5Q2M3G0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB5Q2M3G0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms