Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ME3Q16798 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME3Q16798 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME3Q16798 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME3Q16798 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME3Q16798 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME3Q16798 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME3Q16798 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME3Q16798 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME3Q16798 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME3Q16798 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME3Q16798 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME3Q16798 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME3Q16798 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME3Q16798 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME3Q16798 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME3Q16798 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ME3Q16798 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME3Q16798 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME3Q16798 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME3Q16798 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME3Q16798 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME3Q16798 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ME3Q16798 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME3Q16798 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME3Q16798 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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