Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAMP3Q15836 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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VAMP3Q15836 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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VAMP3Q15836 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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VAMP3Q15836 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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VAMP3Q15836 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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