Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIV2LQ15477 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKIV2LQ15477 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms