Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-6■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.297e-9■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.477e-9■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 CTSB-222ENST00000531551 1855 ntTSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.695e-8■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.625e-8■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.485e-8■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.365e-8■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.285e-8■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.462e-12■■■□□ 16.3
PCBP1Q15365 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.264e-9■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.424e-9■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 VPS52-217ENST00000478934 2602 ntTSL 211□□□□□ -0.654e-9■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.866e-7■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 FAM53C-206ENST00000507506 988 ntTSL 219.94■□□□□ 0.786e-7■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.556e-7■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 FAM53C-201ENST00000239906 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.576e-7■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.168e-7■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.489e-7■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.362e-6■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.192e-6■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 GSTM4-212ENST00000495742 1159 ntTSL 1 (best)23.87■■□□□ 1.413e-8■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.953e-8■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.073e-8■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 GSTM4-202ENST00000336075 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.293e-8■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 GSTM4-213ENST00000638994 657 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.293e-8■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 GSTM4-211ENST00000493395 913 ntTSL 312□□□□□ -0.493e-8■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 GSTM4-203ENST00000369833 3990 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.023e-8■■■□□ 16.2
PCBP1Q15365 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.872e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.149e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 CRACR2B-214ENST00000534606 627 ntTSL 325.55■■□□□ 1.681e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 CRACR2B-204ENST00000527089 824 ntTSL 324.43■■□□□ 1.51e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 CRACR2B-206ENST00000528315 575 ntTSL 320.58■□□□□ 0.891e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 CRACR2B-209ENST00000530183 530 ntTSL 520.58■□□□□ 0.891e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 CRACR2B-212ENST00000533803 742 ntTSL 218.08■□□□□ 0.481e-7■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.767e-8■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PCBP2-223ENST00000552819 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.616e-10■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.866e-10■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.284e-9■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 HDLBP-241ENST00000487169 4339 ntTSL 213.67□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.471e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 HDLBP-202ENST00000373292 3297 ntTSL 511.72□□□□□ -0.531e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.61e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.851e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.012e-20■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 DDB1-224ENST00000545894 2282 ntTSL 211.6□□□□□ -0.552e-20■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 DDB1-212ENST00000538470 858 ntTSL 29.67□□□□□ -0.862e-20■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 DDB1-203ENST00000451943 1224 ntTSL 29.15□□□□□ -0.942e-20■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 DDB1-217ENST00000540166 3906 ntTSL 28.73□□□□□ -1.012e-20■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 IDUA-206ENST00000508168 520 ntTSL 326.3■■□□□ 1.81e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.641e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 LUC7L-219ENST00000494545 725 ntTSL 524.98■■□□□ 1.591e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.961e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 LUC7L-218ENST00000494366 668 ntTSL 320.75■□□□□ 0.911e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.841e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.781e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.771e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RBM14-RBM4-202ENST00000421355 2034 ntTSL 219.85■□□□□ 0.771e-8■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 ANAPC2-203ENST00000483432 793 ntTSL 219.76■□□□□ 0.751e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.651e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 LUC7L-207ENST00000426094 2737 ntTSL 1 (best)19.02■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 LUC7L-214ENST00000467552 569 ntTSL 1 (best)18.95■□□□□ 0.621e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.611e-8■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.461e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.411e-8■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 COASY-207ENST00000587214 539 ntTSL 416.52■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 COASY-203ENST00000585811 625 ntTSL 216.46■□□□□ 0.231e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 SYMPK-211ENST00000598364 995 ntTSL 316.32■□□□□ 0.21e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 GOLGA2-202ENST00000450617 1439 ntTSL 516.02■□□□□ 0.151e-8■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 COASY-208ENST00000587858 569 ntTSL 415.83■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 LUC7L-206ENST00000419516 1211 ntTSL 515.1■□□□□ 0.011e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-8■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.041e-8■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.051e-8■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RHOBTB3-207ENST00000506959 547 ntTSL 514.52□□□□□ -0.091e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 LUC7L-217ENST00000490762 2643 ntTSL 1 (best)13.89□□□□□ -0.191e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RBM14-RBM4-204ENST00000511114 523 ntTSL 413.67□□□□□ -0.221e-8■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 LUC7L-210ENST00000430864 695 ntTSL 513.31□□□□□ -0.281e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 LUC7L-205ENST00000418978 989 ntTSL 513.24□□□□□ -0.291e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RHOBTB3-205ENST00000504949 1511 ntTSL 213.07□□□□□ -0.321e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 SYMPK-207ENST00000596824 653 ntTSL 312.96□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.451e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PACSIN1-201ENST00000244458 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.51e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PACSIN1-202ENST00000374043 4229 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.51e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 GOLGA2-214ENST00000611957 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.581e-8■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 GOLGA2-201ENST00000421699 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.621e-8■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PACSIN1-206ENST00000538621 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.651e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RHOBTB3-202ENST00000502541 693 ntTSL 58.02□□□□□ -1.131e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 SMARCD1-210ENST00000551352 621 ntTSL 27.86□□□□□ -1.151e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PICALM-213ENST00000530542 905 ntTSL 56.75□□□□□ -1.331e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PICALM-212ENST00000529760 1153 ntTSL 56.75□□□□□ -1.331e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PICALM-220ENST00000532603 566 ntTSL 46.08□□□□□ -1.441e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PICALM-214ENST00000530692 963 ntTSL 55.82□□□□□ -1.481e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PICALM-211ENST00000529016 757 ntTSL 35.57□□□□□ -1.521e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PICALM-207ENST00000526961 802 ntTSL 55.56□□□□□ -1.521e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 PICALM-222ENST00000534375 390 ntTSL 25.4□□□□□ -1.541e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 RHOBTB3-211ENST00000510623 333 ntTSL 25.15□□□□□ -1.591e-6■■■□□ 16.1
PCBP1Q15365 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.791e-6■■■□□ 16.1
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 187.9 ms