Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMC1AQ14683 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms